Своими корнями история музея уходит в 60-е годы XX века к кафедре общей геологии, на которой постепенно в рамках лаборатории «оседали» различные редкие минералы.Музей по праву можно назвать кладовой, в данный момент в его фонде выставлено 1670 образцов, при этом полная коллекция насчитывает около 7 тысяч экземпляров.