Подготовительные работы по возведению храма начались весной 1996 г. на цоколе так и не построенного всвязи с развалом СССР 14-этажного дома, безвозмездно переданного приходу руководством Игналинской Атомной станции (АЭС) по просьбе настоятеля о.Иосифа.
9 августа 2000 г. Митрополит Хризостом освятил храм во имя святого великомученика и целителя Пантелеимона, где стали регулярно совершаться богослужения. Строительство второго этажа храма, как вначале и первого, осуществляется благодаря финансовой поддержке епархии, АЭС, Висагинского Самоуправления, а также частным пожертвованиям.
В храме во имя святого великомученика Пантелеимона в городе Висагинас служат три клирика: настоятель протоиерей Иосиф Затеишвили, благочиннный Висагинского благочиннического округа, протоиерей Георгий Саломатов, и диакон Валентин Гасюлевич.